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EMU900型是台鐵因應西部幹線捷運化政策及南迴鐵路電氣化完工，加上準備淘汰摺疊門莒光號及復興號車廂^[6][7]及原有車輛已不敷使用，

繼2007年購置20列40組160輛EMU700型、

2012年購置43列86組344輛EMU800型並獲好評後，

以2015-2024年度臺鐵整體購置及汰換車輛計畫辦理購置^[8]。

該款通勤電聯車也是台鐵繼2012年EMU800型電聯車採購案後最大宗的台鐵電聯車採購案，於2020年至2023年間完成交車^[9][10]。

台鐵預計在陸續完成交車後，

原配置於臺北機務段的EMU500將移往宜花東或電氣化支線行駛，

新竹機務段的EMU800將移至中南部行駛，

七堵機務段配屬車輛預計將行駛區間快車，

該款列車則預計投入縱貫線北段區間車及宜蘭線及縱貫線山線及嘉義以北之縱貫線南段中長途區間快車等班次運用，

以期藉此舒緩臺灣北部都會區間的尖峰時段運量，

並填補中南部都會區間的尖峰時段班距過長的問題.

2020年4月22日，現代樂鐵原承諾提早至6月26日可交車，但受疫情影響人力調度困難，

且零件物料來自世界各地，如韌機來自德國、集電弓來自法國等，導致需要延遲交車。