善化糖廠位於台南市善化區溪美里310號，為台灣糖業公司現有的二座壓榨甘蔗糖廠之一，隸屬於砂糖事業部。

1904年5月(民前8年)，由台南王雪農、陳鴻鳴、蘇有志等募集資金，創辦台南製糖株式會社，1906年5月開始營運。1909年10月，由台灣製糖株式會社承繼，因善化地名舊稱「灣裡街」而改稱灣裡製糖所。建廠初期的壓榨甘蔗量為每日180公噸，於1928年擴建第二工場，壓榨甘蔗能力增至1,000公噸。1945年台灣光復，由台灣糖業監理委員會第二分會接管。1946年改稱台灣糖業公司第二分公司灣裡糖廠。1950年7月，改隸屬於台灣糖業公司總爺總廠。1953年開始經營試辦營業線玉善線。

1959年3月，自溪州糖廠遷裝日壓1,500公噸壓榨設備，壓榨量提高至日壓3,000公噸。經逐年擴建改善。更新壓榨設備2列各1,700公噸，每日壓榨甘蔗量提高至3,400公噸[1]，年生產糖量約2.48萬公噸。

灣裡糖廠，於1961年7月更名為善化糖廠。善化糖廠於1990年11月兼併永康糖廠及麻豆糖廠，麻豆工場繼續製糖作業。於1992年10月兼併玉井糖廠。1994年7月麻豆工場停壓佳里糖廠接管。1995年7月玉井工場停壓，廠區由善化糖廠接管。1998年7月1日佳里糖廠裁撤，由善化糖廠接管。於2003年7月併入仁德糖廠及新營糖廠。善化糖廠於2004年舉行慶祝建廠一百週年活動。

2008年南靖糖廠停壓，南靖原料課於2008年6月1日，併入善化糖廠。現在嘉義以南地區，僅剩善化糖廠繼續壓榨甘蔗製糖，併入的各廠區進行轉型開發。

善化糖廠已不再使用鐵路運輸製糖原料，但在廠內仍使用鐵路搬運已包裝好的成品糖。

昔年鐵路:
善化線（善化─公誠村）

玉善線（玉井-善化）-1975年全線旅客業務廢止

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