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對於主動採檢正在居家檢疫中的民眾，彰化縣長王惠美表示，因為擔心社區感染風險，縣府早在4月就開始針對高風險族群進行精準篩檢，希望能補防疫漏洞；而衛生局長葉彥伯先前也曾提到，篩檢前都會事先詢問意願，在取得同意的情況下才會做。

陳時中今也提到此事最受爭議的部分，為居家檢疫者在不得與人接觸的情況下，如何執行採檢？且如果沒症狀，那檢驗的理由又是什麼？強調會請政風處調查，並非把它當作犯罪行為，而是希望釐清事實。

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面對各界質疑，葉彥伯今受訪時表示，居家檢疫者不論有無症狀，都是由衛生局安排到醫院採檢，並由醫院依社區監測通報採檢標準程序執行，而費用是由醫院申報，不會經過衛生局；至於採檢的數據、資料和人數等，葉彥伯表示，這些資料在系統裡都查得到，中央想了解隨時可查。據《中央社》報導，醫院回應指出，若衛生局轉介民眾到院採檢，僅需付掛號費及部分負擔，其餘則由院方向疾管署申報。

檢驗經費來源曝光後，不少網友紛表示，「我看找政風處不夠了」、「隔離的怎麼去醫院的」、「所以彰化私自違反隔離規定普篩，全國幫他買單？」、「無症狀不能篩檢，所以申請經費的名義為何？」、「叫政風去查真的剛好而已」、「這樣其他縣市自費的是傻子嗎」、「有衛生局安排是有症狀要自己通報1922之後才安排，不是地方衛生局要怎麼搞就怎麼搞」、「醫生懷疑可以主動驗，但明顯和彰化這套流程不一樣」、「越講洞越大」、「健保局也不會第一時間馬上知道合不合程序，都是事後稽核的」、「中央的SOP可不是這樣喔，憑什麼衛生局可以叫中央付錢」、「無症狀自費7000元，有症狀才可以請公費」。

對於外界頻籲「入境全面篩檢」一事，指揮中心在本月初即表示，我國現行對於入境者全面居家檢疫之做法，即使有極少數無症狀者個案未於入境時被攔檢，經過14天居家檢疫後，其傳染力已大幅降低或幾乎已無傳染力，於檢疫期滿後再自主健康管理7天、持續密切追蹤健康狀況，已可有效防堵社區傳播風險。娛樂城

指揮中心進一步說明，實施相關篩檢作業必須另行支應採檢、檢驗、防護裝備費用，以我國近期每日平均1200名入境旅客估算，每日即須花費至少400至500萬元，成本高昂但效果並未優於現有策略。