本會農產加工廠成立於民國75年，並推廣紅薏仁、蕎麥系列產品，為適應時事變遷由總幹事蔡詩傑在97年推動二林鎮農會農產加工廠改善設備及環境衛生導入ISO國際認證計畫，期待本會農特產品能走向國際化，於硬體設備及製程環境做突破性的改善，並引進國際認證單位的技術及品管，經過一年的努力，於民國98年6月1日正式通過ISO-22000食品安全管理系統認證。

在未來本會將本著ISO國際認證精神以生產優質、安全、衛生的農特產品為目標，同時響應行政院農業委員會『新農業運動-台灣農業亮起來』及發展地方特色的農業永續經營，打造創力農業、活力農民、魅力農村的台灣農業新境界。