1. 按病毒發作的時間命名這種命名取決於病毒表現或破壞系統的發作時間，這類病毒的表現或破壞部分一般為定時炸彈，如"黑色星期五"，是因為該病毒在某月的13日恰逢星期五時破壞執行的文件而得名；又如"米氏"病毒，其病毒發時間是3月6日，而3月6日是世界著名藝術家米開朗基羅的生日，於是得名"米開朗基羅"病毒。
2. 按病毒發作症狀命名以病毒發作時的表現現象來命名，如"小球"病毒，是因為該病毒病發時在屏幕上出現小球不停地運動而得名；又如"火炬"病毒，是因為該病毒病發時在屏幕上出現五支閃爍的火炬而得名；再如Yankee病毒，因為該病毒激發時將演奏Y_ ankee Doodle樂曲，於是人們將其命為Yankee病毒。
3. 按病毒自身包含的標誌命名以病毒中出現的字符串、病毒標識、存放位置或病發表現時病毒自身宣布的名稱來命名，如"大麻"病毒中含有Mar_ ijunana及Stoned字樣，所以人們將該病毒命名為Marijunana(譯為"大麻")和Stoned病毒；又如"Liberty"病毒，是因為該病毒中含有該標識；再如"DiskKiller"病毒，該病毒自稱為DiskKiller(磁盤殺手)。  CIH病毒是由劉韋麟博士命名的，因為病毒程序的首位是"CIH"。
4. 按病毒發現地命名以病毒首先發現的地點來命名，如"黑色星期五"又稱Jurusalem(耶路撒冷)病毒，是因為該病毒首先在Jurusalem發現；又如Vienna(維也納)病毒是首先在維也納發現的。
5. 按病毒的字節長度命名以病毒傳染文件時文件的增加長度或病毒自身代碼的長度來命名，如1575、2153、1701、1704、1514、4096等。

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