受到莫拉克颱風影響，教育部校安中心最新統計的災損學校數已增加到1千103校，災損總金額預估超過6億4千萬多元。對於災區學生安置、就學問題，教育部表示，如果學生能依親安置，將函請各縣市轉知所屬國中小，主動接受災區學生入學，並提供必要協助，而災區高中職學生如果想轉學，也可撥打專線電話(04-37061700、1701、1750或1812)尋求協助。

協助風災受損學校完成復建工作，教育部已先撥款3千萬元給最嚴重的屏東縣，2千萬元給高雄縣作為重建經費。教育部長鄭瑞城到災區學校視察時，發現台南縣龍潭國小附設幼稚園有一名懷孕女老師，還回校協助清掃環境覺得很感動，特別對所有協助學校復原、清掃的校長、老師表達敬意。而在通報災損學校中，可能無法在9月順利開學的有高雄縣甲仙鄉的小林國小、那瑪夏鄉的三民國中、民生國小、民族國小，還有南投神木村的龍華國小，都因為土石流掩埋或嚴重傾斜，教育部國教司司長楊昌裕表示，這些災區學校的學生將就近安置，如果要依親，也會通令所有縣市轉告所屬國中小，主動接受災區學生入學，不受學區的限制。

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