(以下檔案皆已整理成冊)

*姚孝彥全集之一：佛經釋論

1.大佛頂首楞嚴經導論（一巨冊）

2.大佛頂首楞嚴經真偽辨（二冊）

3.大佛頂首楞嚴經釋論（十五冊）

4.金剛般若波羅蜜經釋論（四冊）

5.般若心經性空義釋論（五冊）

6.般若心經精義（一小冊）

7.八大人覺經釋論

8.維摩詰所說經釋論

9.勝鬘經釋論

10.那先比丘經釋論

11.妙慧童女經釋論（二冊）

12.圓覺經釋論（四冊）

13.楞伽阿跋多羅寶經釋論

14.妙法蓮華經寓義釋析

15.大乘遍照光明藏無字法門經釋論（三冊）

16.六祖壇經釋論（五冊）

17.大乘起信論釋論（五冊）

18.證道歌釋論（二冊）

19.華嚴經揭義

20.稱讚大乘功德經釋論

*姚孝彥全集之二：佛法論著

21.佛學真義 22.真實的佛法

23.法海擷珠 24.大道歌釋論（二冊）

25.瀚海文瀾 26.佛陀的正法（二冊）

27.大乘的主旨在菩薩道（二冊）

28.佛法在解決現實的生命（二冊）

29.佛家輪迴真義探究（正、續）

30.大乘確是佛說（一冊）

31.佛教神通感應解析（佛經宗教文學揭密）（五冊）

32.正法與道化佛教解析（四冊）

33.大菩提頌論（五冊）

34.性空正義的考察（一冊）

35.龍樹空學原義及其價值（二冊）

36.空谷傳聲（一冊）

37.芸齋遊翰（文集）

38.佛法的正義

*姚孝彥全集之三：禪學

39.禪門囈語（一冊）

40.禪骨詩心（一冊）

41.教外別傳的禪宗．禪學隨記（合訂）

42.禪詩拈義（一冊）

*姚孝彥全集之四：傳記

43.草嶺山下的行者（《姚各風行者傳》）

44.塵影漫囈（自傳）

*姚孝彥全集之五：國學

45.大學釋論（二冊）

46.中庸釋論（二冊）

47.論語釋論（二冊）

48.道德經釋論（二冊）

49.莊子釋論（一冊）

50.詩經釋論（國風）

51.千字文釋論 52.實用切音方法

*姚孝彥全集之六：詩學

53.唐詩發蒙釋論

54.詩學淺說

55.禪詩隨詠

56.艋舺風詠

57.大溪風詠

     *張家界遊蹤、角板山詩記

      *雁蕩山遊蹤、紅淡山詩記

      *武夷山詩記、坪林吟蹤

　   *祖師禪風、空谷清音

          *芝山巖詩記

59.崙山綴珠

60.芸窗詩集

61.四大名山朝聖吟草

62.佛教石窟巡禮吟集

*姚孝彥全集之七：書評

63.評《佛心流泉》

64.評《死在虛空裡的和尚》

*姚孝彥全集之八：破邪

65.偽經析論

66.歸途

67.一貫道探隱

68.《理數合解》探究

69.從佛經透視一貫道義理

70.天道佛書

71.「佛乘宗、大乘禪」是佛法嗎？