上文有提及，「能回應刺激」是「生命」（含病毒、細菌、植物）的基本要件，所以「能回應刺激」只是一種生化作用，並非意識，因此，「意識」有更多、更高的層次。

一、能對刺激能產生「感受」（如痛感、熱感）」，即比人的眼耳鼻舌身五官的「感知」又更高階的「感受」（前五識，consciousness）。

二、累積前五識，進而產生情緒與心理因素的「意識」（第六識，consciousness），但這個並不是記憶、思考（運算），因為記憶、思考（運算）也只是生化作用， 譬如，我們的腦細胞就是藉由生化和電位變化來進行記憶和思考，這個作用甚至只是機械作用，譬如電腦的記憶、思考（運算）能力比人還高。

三、累積前六識，產生「我」的覺知（第七意識，will），譬如，嬰兒是在六個月後才開始萌生「我」的初步概念，到一歲半「我」的概念才確立（https://paper.udn.com/udnpaper/POI0032/274661/web/）。如果一個嬰兒從出生起就被單獨禁錮在暗房與世隔絕，那他會一直沒有我的概念產生。而「我」概念的產生，是一個重要的分界，因為，沒有我的概念時，意識對世界的認知是一體的，我的概念產生後，意識對世界的認知是分別的。

四、我們一般認為死後或輪迴的主體是靈魂，但靈魂並不只是一個能量團，它更核心的東西是一個藏有無數資料密碼的先天意識（第八意識，will），亦即，靈魂的能量團是第八意識的載體，就猶如人類把他的思想透過數位程式記載在磁片或磁碟上一樣。（人把思想寫成軟體記載在磁片或磁碟上，再透過磁片或磁碟去驅策電腦；就好像，第八意識藏在靈魂裡，靈魂又去驅策身體一樣。）

五、那麼先天意識是怎麼來的？一神教認為一開始是上帝賜予人類始祖亞當和夏娃，再由他們透過生殖遞延給後代的，而且上帝只賦予人類靈性；道教則認為意識是與天俱來的，當氣匯聚成物時，物就有意識，所以萬物都有意識（真正的泛神論，應該說是泛靈論）；佛教認為是從意識種子（如來藏）產生出來的（註）。

原則上，當我們一層一層往上推演到先天意識是從哪裡來的時，已經超出人類的科學層次，而變成是一種信仰問題。雖然最後還是會走回信仰，但這不表示科學不重要（這個時代否認科學重要性的，只有死路一條），因為在這個思辯的過程中，會讓我們更清理解信仰的真義。

註：有「我的概念」的第八意識，在去除我執的概念後，又回歸沒有我執的整體大意識（這是從形下角度，亦即人的角度看），榮格稱它為「集體潛意識」，佛教稱為「如來藏」。但如果我們從形上角度看，整體大意識（如來藏）並不需要依賴時間、空間、物質、能量以及任何載體而存在，而且此時「我的概念」已經消失，所以整體大意識（如來藏）並沒有任何存在與分別的概念，那就是一個如如不動的「真如」境界，並且是化生形下世界的種子，人的第八意識就是從此而來。

至於如來藏是如何而來的，如如不動的真如境界又怎會產生人的第八意識，在哲學上，那又是另一個唯物論、唯心論或造物論的問題；而在科學上，那就好像，為什麼宇宙會大爆炸，最後黑洞收斂了整個宇宙後，是否又產生大爆炸一樣，是一個玄之又玄的問題。